Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CUL4BQ13620 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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