Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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