Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC27P30260 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms