Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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