Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
XIRP2A4UGR9 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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