Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U3KQA8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U3KQA8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U3KQA8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
U3KQA8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U3KQA8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KQA8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KQA8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KQA8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KQA8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KQA8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KQA8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms