Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCAF1Q9Y4C2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms