Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9Y3F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q9Y3F1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9Y3F1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms