Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGTPBP1Q9UPW5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms