Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LRFN2Q9ULH4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN2Q9ULH4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms