Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms