Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R1BQ9UD71 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R1BQ9UD71 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms