Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC3IPQ9P2W1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMC3IPQ9P2W1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms