Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ARHGEF12Q9NZN5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF12Q9NZN5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms