Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP4R2Q9NY27 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP4R2Q9NY27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP4R2Q9NY27 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP4R2Q9NY27 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP4R2Q9NY27 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP4R2Q9NY27 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms