Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms