Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAR1AQ9NR31 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms