Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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