Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTA1Q9NP79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VTA1Q9NP79 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms