Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPV4Q9HBA0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPV4Q9HBA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms