Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABDQ9H4I3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABDQ9H4I3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms