Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL3Q9BY60 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL3Q9BY60 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms