Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDCA4Q9BXL8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms