Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP5Q96RT8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP5Q96RT8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms