Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ARAP1Q96P48 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARAP1Q96P48 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARAP1Q96P48 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARAP1Q96P48 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms