Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NSMCE2Q96MF7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NSMCE2Q96MF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms