Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC138Q96M89 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms