Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM17Q96I25 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM17Q96I25 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms