Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BCANQ96GW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
BCANQ96GW7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms