Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNPO1Q92973 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNPO1Q92973 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNPO1Q92973 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms