Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCD2Q92925 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD2Q92925 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD2Q92925 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD2Q92925 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD2Q92925 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD2Q92925 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD2Q92925 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD2Q92925 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD2Q92925 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms