Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP61Q8NHU2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms