Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPC24Q8NBT2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms