Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM229BQ8NBD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms