Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNBD1Q8NA66 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms