Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC43Q8N309 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms