Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC170Q8IYT3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC170Q8IYT3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms