Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT13Q7L8C5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYT13Q7L8C5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms