Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
HECW1Q76N89 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
HECW1Q76N89 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms