Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PACS1Q6VY07 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PACS1Q6VY07 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms