Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP26C1Q6V0L0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP26C1Q6V0L0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP26C1Q6V0L0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP26C1Q6V0L0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP26C1Q6V0L0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP26C1Q6V0L0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26C1Q6V0L0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms