Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VITQ6UXI7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VITQ6UXI7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VITQ6UXI7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VITQ6UXI7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VITQ6UXI7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VITQ6UXI7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VITQ6UXI7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms