Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms