Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC4Q6P4E1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms