Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDF6Q6KF10 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF6Q6KF10 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms