Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CARMIL1Q5VZK9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
CARMIL1Q5VZK9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CARMIL1Q5VZK9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms