Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL40Q2TBA0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL40Q2TBA0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL40Q2TBA0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms