Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM71Q2Q1W2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms