Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms