Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCEA2Q15560 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCEA2Q15560 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA2Q15560 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA2Q15560 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA2Q15560 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA2Q15560 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA2Q15560 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA2Q15560 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCEA2Q15560 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms